Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2Q9CUU3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms