Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms