Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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