Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms