Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tma16Q9CR02 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms