Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PompQ9CQT5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms