Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rpl39lQ9CQD0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rpl39lQ9CQD0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rpl39lQ9CQD0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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