Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQ90 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms