Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700129C05RikQ9CQ77 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms