Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CPS8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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