Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms