Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms