Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms