Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsnaxip1Q99P25 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms