Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem2Q99NH8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms