Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc26a5Q99NH7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms