Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac9Q99N13 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms