Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SncaipQ99ME3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms