Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms