Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Sh3bp5lQ99LH9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Sh3bp5lQ99LH9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Sh3bp5lQ99LH9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Sh3bp5lQ99LH9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Sh3bp5lQ99LH9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Sh3bp5lQ99LH9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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