Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms