Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms