Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms