Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q99KU6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q99KU6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q99KU6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q99KU6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q99KU6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q99KU6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q99KU6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q99KU6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q99KU6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q99KU6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms