Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms