Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms