Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms