Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd1bQ99JY6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms