Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ddb2Q99J79 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ddb2Q99J79 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ddb2Q99J79 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ddb2Q99J79 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ddb2Q99J79 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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