Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn16Q925N4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn16Q925N4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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