Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sntg2Q925E0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg2Q925E0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms