Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms