Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms