Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms