Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip1Q922J3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms