Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps36Q91XD6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms