Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms