Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csde1Q91W50 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms