Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Smg8Q8VE18 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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