Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms