Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms