Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms