Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms