Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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