Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms