Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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