Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vrk3Q8K3G5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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