Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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