Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms