Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr3Q8K296 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr3Q8K296 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr3Q8K296 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr3Q8K296 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr3Q8K296 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr3Q8K296 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr3Q8K296 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr3Q8K296 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms